编码多肽或蛋白的lncRNA和circRNA研究

编码多肽或蛋白的lncRNA和circRNA研究
越来越多的研究表明，有的lncRNA和circRNA也能编码多肽或蛋白(1-5)；且部分多肽还具有重要生理功能(2)。为系统研究具多肽或蛋白编码功能的lncRNA或circRNA，我司制定了能快速准确筛选它们及探究其产物功能的个性化解决方案。基本思路基于编码蛋白的RNA有开放阅读框（ORF），翻译时会与核糖体结合及能产生对应的多肽或蛋白产物，包括以下4个步骤：

建立数据库
核糖体-RNA复合物分离→lncRNA/circRNA测序→ORF预测→建立多肽或蛋白数据库

质谱鉴定
样本总蛋白→一定大小范围的蛋白做质谱鉴定→数据匹配

筛选具有编码能力的lncRNA/circRNA
综合1和2的结果筛选出具有多肽或蛋白编码功能的lncRNA/circRNA

验证及功能研究
lncRNA/circRNA编码的多肽或蛋白验证及相关功能探究


 
References
1.             Anderson DM, et al. (2015) A micropeptide encoded by a putative long noncodingRNA regulates muscle performance. Cell 160(4):595-606.  [IF>30]
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